Jeu de données
Registre d'admissions et de sorties PCIMA — 2024
1 100 admissions réparties sur six sites, portant à la fois le PB et le poids-pour-taille à l'admission, de sorte que le désaccord entre les deux critères d'admission devienne mesurable plutôt qu'affirmé, et l'issue thérapeutique sur laquelle tout rapport PCIMA est jugé.
- Lignes
- 1 100
- Variables
- 14
- Période
- 2024-01-08 au 2024-12-31
- Licence
- CC BY 4.0
- Complétude
- 93%
Normes et méthodologies
Fichiers
Les fichiers sont versionnés par leur nom. Une correction est publiée sous .v2.csv plutôt qu'en remplaçant le fichier, afin qu'une analyse figée sur la v1 continue de se reproduire à l'identique.
Dictionnaire des variables
| Variable | Type | Description | Valeurs autorisées |
|---|---|---|---|
child_id | string | Identifiant pseudonyme d'enfant, un par épisode d'admission. Un enfant réadmis après rechute apparaît deux fois. | — |
site_id | categorical | Site de traitement. Six sites, dont l'un dessert un bassin situé environ deux heures plus loin. | SITE-01, SITE-02, SITE-03, SITE-04, SITE-05, SITE-06 |
admission_date | date | Date d'admission de l'enfant en traitement. | — |
age_monthsmois | integer | Âge en mois révolus à l'admission. | — |
sex | categorical | Sexe de l'enfant tel qu'enregistré à l'admission. | f, m |
programme | categorical | Programme de traitement. Ambulatoire thérapeutique, supplémentation ciblée, ou stabilisation hospitalière. | otp, tsfp, sc |
admission_criterion | categorical | Le critère que le site a consigné comme motif d'admission. Un enfant peut en remplir plusieurs ; ceci enregistre celui qui a été saisi. | muac, whz, oedema |
muac_admission_mmmm | integer | Périmètre brachial à l'admission. | — |
weight_admission_kgkg | float | Poids à l'admission. | — |
height_cmcm | float | Longueur ou taille à l'admission. Manquante pour une part des admissions, ce qui rend le poids-pour-taille incalculable pour elles. | — |
oedema_admission | boolean | Œdèmes bilatéraux prenant le godet à l'admission. L'œdème signe une malnutrition aiguë sévère quelle que soit l'anthropométrie. | true, false |
discharge_date | date | Date de sortie. Vide pour les enfants encore en traitement à la date d'arrêt du rapportage. | — |
weight_discharge_kgkg | float | Poids à la sortie. Vide lorsque l'enfant n'avait pas été déchargé. | — |
outcome | categorical | Issue thérapeutique. Vide pour les enfants encore en traitement à la date d'arrêt, ce qui n'est pas une issue et ne doit pas être compté comme telle. | cured, defaulted, died, non-response, transferred |
Provenance
Qualité des données
- Chaque enregistrement est généré. Aucun enfant réel n'est décrit et ces chiffres ne doivent jamais être cités comme une performance de programme réelle.
- Le dénominateur est le constat. 1 100 enfants ont été admis ; 984 ont atteint une issue thérapeutique, 45 ont été transférés et 71 étaient encore en traitement à la date d'arrêt. La performance Sphere se calcule sur les enfants ayant atteint une issue, transferts exclus — 82,3 % guéris, 13,7 % d'abandons, 1,0 % de décès, 2,9 % de non-réponse. Divisez le même effectif de guéris par les 1 100 admissions et le taux de guérison affiche 73,6 %.
- Le site 3 enregistre 20,5 % d'abandons contre 11,2 % au meilleur site. Le programme dans son ensemble est sous le maximum Sphere de 15 % et un site ne l'est pas, ce qui est exactement le cas qu'un chiffre de district masque.
- Les deux mesures d'admission sont enregistrées pour chaque enfant ayant une taille, ce qui rend les critères comparables. Parmi les enfants sévèrement malnutris selon l'une ou l'autre mesure, 468 le sont selon le seul poids-pour-taille, 24 selon le seul PB et 142 selon les deux — soit une concordance de 22,4 %. Sur la malnutrition aiguë tous degrés confondus, les deux s'accordent sur 51,9 %.
- Le désaccord n'est pas du bruit, c'est l'âge. Les enfants sévères selon le seul PB ont 14,3 mois en moyenne ; ceux qui le sont selon le seul poids-pour-taille, 31,4 mois. Le PB croît avec l'âge indépendamment de l'état nutritionnel, et c'est pourquoi un programme admettant sur un seul critère ne traite pas la charge de cas que l'autre aurait trouvée.
- Les œdèmes priment sur l'anthropométrie. Un enfant présentant des œdèmes bilatéraux prenant le godet est en malnutrition aiguë sévère quels que soient son PB et son poids-pour-taille, si bien que la charge sévère n'est pas simplement le décompte sous les seuils.
Problèmes connus
- Soixante-douze admissions (6,5 %) n'ont aucune taille enregistrée, si bien que le poids-pour-taille n'est pas calculable pour elles. Le PB l'est, de sorte que toute analyse comparant les deux critères a des dénominateurs différents à moins de le dire.
- Soixante et onze enfants étaient encore en traitement à la date d'arrêt et n'ont aucune issue. Les compter dans une issue quelconque est faux ; les exclure sans énoncer le dénominateur l'est aussi.
- Quarante-cinq enfants ont été transférés entre programmes. Sphere exclut les transferts du dénominateur de performance, et les inclure modifie tous les taux du tableau.
- Neuf poids de sortie sont inférieurs au poids d'admission. C'est possible chez un enfant décédé ou ayant abandonné précocement, et c'est aussi l'allure d'une saisie inversée ; le registre ne permet pas de les distinguer.
- Le critère d'admission enregistre celui que le site a saisi, non tous les critères que l'enfant remplissait. Un enfant remplissant à la fois le PB et le poids-pour-taille figure sous l'un des deux, si bien que compter les admissions par critère sous-estime le recouvrement.
Exemples traités
Python
Performance PCIMA au regard des standards Sphere
Le même tableau de performance en pandas, avec les trois dénominateurs candidats calculés côte à côte pour rendre visible l'effet de chacun.
Décrit ici ; le notebook est encore en cours de rédaction.
Là où le PB et le poids-pour-taille divergent
Calcule les scores z poids-pour-taille à partir de la table de référence OMS 2006, croise les cas sévères par critère, et décompose le désaccord selon l'âge.
Décrit ici ; le notebook est encore en cours de rédaction.
R
Performance PCIMA au regard des standards Sphere
Construit correctement le dénominateur des issues, calcule guéris, abandons, décès et non-réponse par site et par programme, et signale chaque cellule hors des standards minimums Sphere.
Décrit ici ; le notebook est encore en cours de rédaction.